MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 34052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014002	CTC	2	6	209859	209864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494868
3502	NC_014002	GAA	2	6	209915	209920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494868
3503	NC_014002	CTT	2	6	209993	209998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494868
3504	NC_014002	ATGAA	2	10	210003	210012	60 %	20 %	20 %	0 %	294494868
3505	NC_014002	TG	3	6	210041	210046	0 %	50 %	50 %	0 %	294494868
3506	NC_014002	TGA	2	6	210100	210105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494868
3507	NC_014002	TGA	2	6	210115	210120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494868
3508	NC_014002	AGA	2	6	210277	210282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494869
3509	NC_014002	A	6	6	210367	210372	100 %	0 %	0 %	0 %	294494869
3510	NC_014002	AGCC	2	8	210383	210390	25 %	0 %	25 %	50 %	294494869
3511	NC_014002	GAA	2	6	210407	210412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494869
3512	NC_014002	AATG	2	8	210572	210579	50 %	25 %	25 %	0 %	294494869
3513	NC_014002	CTT	2	6	210583	210588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494869
3514	NC_014002	TCC	2	6	210707	210712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494869
3515	NC_014002	GAA	2	6	210768	210773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494869
3516	NC_014002	AGAA	2	8	210787	210794	75 %	0 %	25 %	0 %	294494869
3517	NC_014002	AT	3	6	210869	210874	50 %	50 %	0 %	0 %	294494869
3518	NC_014002	ATG	2	6	210910	210915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494869
3519	NC_014002	GAA	2	6	210916	210921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494870
3520	NC_014002	CAC	2	6	210928	210933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494870
3521	NC_014002	A	6	6	210955	210960	100 %	0 %	0 %	0 %	294494870
3522	NC_014002	TTTG	2	8	211002	211009	0 %	75 %	25 %	0 %	294494870
3523	NC_014002	AAC	2	6	211040	211045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494870
3524	NC_014002	CTC	2	6	211128	211133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494870
3525	NC_014002	TGAT	2	8	211151	211158	25 %	50 %	25 %	0 %	294494870
3526	NC_014002	GAGCA	2	10	211225	211234	40 %	0 %	40 %	20 %	294494870
3527	NC_014002	CTC	2	6	211268	211273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494870
3528	NC_014002	CCG	2	6	211309	211314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494870
3529	NC_014002	CATC	2	8	211355	211362	25 %	25 %	0 %	50 %	294494870
3530	NC_014002	GTT	2	6	211396	211401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494870
3531	NC_014002	AGA	2	6	211404	211409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494870
3532	NC_014002	GTA	2	6	211417	211422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494870
3533	NC_014002	CAA	2	6	211616	211621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494870
3534	NC_014002	GAT	2	6	211740	211745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494870
3535	NC_014002	CTG	2	6	211757	211762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494870
3536	NC_014002	GCA	3	9	211816	211824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494870
3537	NC_014002	CTG	2	6	211856	211861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494870
3538	NC_014002	AAG	2	6	211862	211867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494870
3539	NC_014002	GAA	2	6	211876	211881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494870
3540	NC_014002	AGA	2	6	211884	211889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494870
3541	NC_014002	GAA	3	9	211891	211899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494870
3542	NC_014002	AGA	2	6	211905	211910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494870
3543	NC_014002	AT	5	10	211982	211991	50 %	50 %	0 %	0 %	294494871
3544	NC_014002	GCA	2	6	211992	211997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494871
3545	NC_014002	GCA	2	6	212058	212063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494871
3546	NC_014002	GAC	2	6	212076	212081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494871
3547	NC_014002	GAA	2	6	212127	212132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494871
3548	NC_014002	GCA	2	6	212145	212150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494871
3549	NC_014002	GCA	3	9	212154	212162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494871
3550	NC_014002	CAG	2	6	212164	212169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494871
3551	NC_014002	CAG	3	9	212176	212184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494871
3552	NC_014002	CTG	2	6	212188	212193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494871
3553	NC_014002	AGA	2	6	212201	212206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494871
3554	NC_014002	GAA	2	6	212223	212228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494871
3555	NC_014002	GAA	2	6	212232	212237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494871
3556	NC_014002	AGA	2	6	212246	212251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494871
3557	NC_014002	AGA	2	6	212512	212517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494872
3558	NC_014002	ATA	2	6	212663	212668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494872
3559	NC_014002	TTC	2	6	212799	212804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494872
3560	NC_014002	GTCCT	2	10	212838	212847	0 %	40 %	20 %	40 %	294494872
3561	NC_014002	GAT	2	6	212966	212971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494872
3562	NC_014002	GCA	2	6	213002	213007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494872
3563	NC_014002	ATT	2	6	213059	213064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494872
3564	NC_014002	TGG	2	6	213159	213164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494872
3565	NC_014002	TGAA	2	8	213258	213265	50 %	25 %	25 %	0 %	294494872
3566	NC_014002	TTC	2	6	213281	213286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494872
3567	NC_014002	GCA	2	6	213405	213410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494873
3568	NC_014002	CCA	2	6	213414	213419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494873
3569	NC_014002	ATTC	2	8	213466	213473	25 %	50 %	0 %	25 %	294494873
3570	NC_014002	T	6	6	213474	213479	0 %	100 %	0 %	0 %	294494873
3571	NC_014002	TTC	2	6	213662	213667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494873
3572	NC_014002	CAA	2	6	213716	213721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494873
3573	NC_014002	GCA	2	6	213828	213833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494873
3574	NC_014002	TGC	2	6	213875	213880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494873
3575	NC_014002	AAT	2	6	213887	213892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494873
3576	NC_014002	CTG	2	6	213900	213905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494873
3577	NC_014002	CCA	2	6	213922	213927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494873
3578	NC_014002	CCGG	2	8	213945	213952	0 %	0 %	50 %	50 %	294494873
3579	NC_014002	GT	3	6	213959	213964	0 %	50 %	50 %	0 %	294494873
3580	NC_014002	GGT	2	6	213965	213970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494873
3581	NC_014002	ATA	2	6	213991	213996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494873
3582	NC_014002	TGT	2	6	214100	214105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494873
3583	NC_014002	ATT	2	6	214113	214118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494873
3584	NC_014002	ATT	2	6	214274	214279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494874
3585	NC_014002	A	6	6	214338	214343	100 %	0 %	0 %	0 %	294494874
3586	NC_014002	CAG	2	6	214411	214416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494874
3587	NC_014002	AGG	2	6	214433	214438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494874
3588	NC_014002	TGC	2	6	214465	214470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494874
3589	NC_014002	AGA	2	6	214543	214548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494874
3590	NC_014002	AAC	2	6	214588	214593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494874
3591	NC_014002	ATA	2	6	214629	214634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494874
3592	NC_014002	TTG	2	6	214732	214737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494874
3593	NC_014002	AGG	2	6	214766	214771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494874
3594	NC_014002	AGC	2	6	214856	214861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494874
3595	NC_014002	GGT	2	6	214866	214871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494874
3596	NC_014002	TCT	2	6	214917	214922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494874
3597	NC_014002	TGG	2	6	214926	214931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494874
3598	NC_014002	GCA	2	6	215028	215033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494874
3599	NC_014002	GCT	2	6	215060	215065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494874
3600	NC_014002	CCT	2	6	215075	215080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494874
3601	NC_014002	CATT	2	8	215224	215231	25 %	50 %	0 %	25 %	294494874
3602	NC_014002	GCT	4	12	215256	215267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494874
3603	NC_014002	TG	3	6	215307	215312	0 %	50 %	50 %	0 %	294494874
3604	NC_014002	CCA	2	6	215350	215355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494874
3605	NC_014002	AT	3	6	215465	215470	50 %	50 %	0 %	0 %	294494874
3606	NC_014002	T	6	6	215486	215491	0 %	100 %	0 %	0 %	294494874
3607	NC_014002	AAGG	2	8	215529	215536	50 %	0 %	50 %	0 %	294494874
3608	NC_014002	TGA	2	6	215650	215655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494874
3609	NC_014002	TTC	2	6	215751	215756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494874
3610	NC_014002	AGC	2	6	215786	215791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494874
3611	NC_014002	TGC	2	6	215945	215950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494874
3612	NC_014002	ACC	2	6	216033	216038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494874
3613	NC_014002	CCT	2	6	216066	216071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494874
3614	NC_014002	AGA	2	6	216091	216096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494874
3615	NC_014002	TGC	2	6	216125	216130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494874
3616	NC_014002	GAA	2	6	216168	216173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494874
3617	NC_014002	CTAT	2	8	216290	216297	25 %	50 %	0 %	25 %	294494875
3618	NC_014002	GAT	2	6	216331	216336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494875
3619	NC_014002	AAC	2	6	216345	216350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494875
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3621	NC_014002	ACT	2	6	216418	216423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494875
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3738	NC_014002	A	6	6	223090	223095	100 %	0 %	0 %	0 %	294494881
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3741	NC_014002	AAG	2	6	223165	223170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494881
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3989	NC_014002	TTCCA	2	10	238428	238437	20 %	40 %	0 %	40 %	294494895
3990	NC_014002	TGAGA	2	10	238478	238487	40 %	20 %	40 %	0 %	294494895
3991	NC_014002	ATG	2	6	238568	238573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494895
3992	NC_014002	TTG	2	6	238667	238672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494895
3993	NC_014002	CATTTG	2	12	238676	238687	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294494895
3994	NC_014002	TAT	2	6	239242	239247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494896
3995	NC_014002	TAT	2	6	239333	239338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494896
3996	NC_014002	AAT	2	6	239339	239344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494896
3997	NC_014002	GAG	2	6	239348	239353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494896
3998	NC_014002	ATT	2	6	239472	239477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494896
3999	NC_014002	GTA	2	6	239730	239735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494897
4000	NC_014002	TCG	2	6	239763	239768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494897

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